染料結合機制:該試劑盒使用了兩種的熒光染料 。一種染料能夠特異性地與大的、完整的和 / 或高度結構化的 RNA,如 mRNA、tRNA、rRNA 相結合;另一種染料則選擇性地與小的 RNA 和 / 或降解的 RNA 結合。當這兩種染料與 RNA 樣品混合后,會根據 RNA 的大小和完整性與相應的 RNA 片段結合。在 Qubit 4 或 Qubit Flex 熒光計的激發下,結合了染料的 RNA 會發出熒光信號,儀器通過檢測熒光信號的強度和比例,來判斷 RNA 樣品的質量和完整性。
精準的信號分析算法:Qubit 4 熒光計和 Qubit Flex 熒光計內置了專門的算法 ,能夠對檢測到的熒光信號進行精確分析。通過對比兩種染料所產生的熒光強度,計算出樣品中大小 RNA 的比例,進而得出一個 RNA IQ 編號(RNA IQ#)。這個編號類似于其他 RNA 質量評分系統,取值范圍為 1 至 10。其中,較小的數值表明樣品主要由小 RNA 組成,可能存在 RNA 降解的情況;較大的數值則表明樣品主要由大 RNA 或具有三級結構的 RNA 組成,RNA 的完整性和質量較高。
快速高效:使用 Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 進行 RNA 質量檢測非常迅速 。科研人員只需將 RNA 樣品加入到 RNA IQ 工作溶液中,然后在 Qubit 4 或 Qubit Flex 熒光計上進行測量,短時間內即可獲得檢測結果。相較于傳統的電泳方法,如凝膠電泳或基于微流體的電泳,該試劑盒大大縮短了檢測時間。例如,使用凝膠電泳檢測 RNA 完整性,從制膠、加樣到跑膠、觀察結果,往往需要數小時;而使用本試劑盒,整個檢測過程可能僅需幾分鐘,顯著提高了實驗效率。
操作簡便:整個檢測過程無需復雜的樣品預處理步驟或特殊的實驗技能 。科研人員只需按照試劑盒說明書的指引,將適量的樣品與工作溶液混合均勻,然后放入熒光計中檢測即可。無需像傳統電泳方法那樣,進行繁瑣的凝膠制備、樣品染色等操作,減少了人為誤差的引入,使得實驗操作更加標準化和便捷。即使是剛接觸 RNA 質量檢測的科研人員,也能在短時間內熟練掌握該試劑盒的使用方法。
結果準確可靠:該試劑盒的檢測結果與傳統的電泳方法具有良好的相關性 。其采用的雙染料結合機制和精準的信號分析算法,能夠準確區分完整的 RNA 和降解的 RNA,為科研人員提供可靠的 RNA 質量評估結果。同時,該試劑盒在檢測過程中,對常見的干擾物質,如鹽類、蛋白質、溶劑以及 RNA 穩定試劑等具有較好的耐受性,即使樣品中存在這些物質,也能準確評估 RNA 的質量,避免了因雜質干擾而導致的誤判。
信號穩定性好:試劑盒產生的熒光信號在 1 小時內保持穩定 。這意味著科研人員在完成樣品與工作溶液的混合后,有足夠的時間進行多次測量或對多個樣品進行依次檢測,無需擔心信號衰減對結果準確性的影響。這種良好的信號穩定性,進一步保證了實驗結果的可靠性和可重復性。
二代測序(NGS):在二代測序實驗中,RNA 的質量直接影響測序數據的質量和準確性 。使用 Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 對 RNA 樣品進行質量評估,可以確保進入測序流程的 RNA 是高質量、完整的,從而提高測序文庫的構建效率,減少測序過程中的錯誤和偏差,為后續的生物信息學分析提供可靠的數據基礎。例如,在轉錄組測序中,高質量的 RNA 能夠更準確地反映細胞內的基因表達情況,幫助科研人員發現新的基因轉錄本和表達差異基因。
RNA 測序(RNA-Seq):與二代測序類似,RNA-Seq 實驗對 RNA 的質量要求也很高 。通過該試劑盒評估 RNA 質量,能夠篩選出適合進行 RNA-Seq 的樣品,避免因 RNA 降解而導致的測序數據丟失或不準確。對于研究基因表達調控、轉錄后修飾等方面的科研工作,準確的 RNA-Seq 數據至關重要,而 Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 為獲得高質量的 RNA-Seq 數據提供了有力保障。
基因表達分析:無論是使用實時定量 PCR(qPCR)還是基因芯片等技術進行基因表達分析,RNA 的完整性都會影響實驗結果的準確性 。使用該試劑盒檢測 RNA 質量,能夠確保用于基因表達分析的 RNA 樣品具有良好的質量,從而使檢測到的基因表達水平更真實地反映細胞的生理狀態。例如,在研究疾病發生發展過程中的基因表達變化時,準確的 RNA 質量評估能夠幫助科研人員更準確地判斷基因表達的差異,為揭示疾病的發病機制提供可靠依據。
其他 RNA 相關研究:在 RNA 干擾(RNAi)實驗、體外轉錄實驗等其他涉及 RNA 的研究中,RNA 的質量同樣會對實驗結果產生重要影響 。Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 可用于這些實驗前的 RNA 質量篩選,保證實驗材料的可靠性,提高實驗的成功率。例如,在 RNAi 實驗中,高質量的 RNA 能夠更有效地介導基因沉默,增強實驗效果;在體外轉錄實驗中,完整的 RNA 模板能夠提高轉錄產物的產量和質量。
樣本準備:使用試劑盒前,需準備適量的 RNA 樣品 。確保樣品的濃度在試劑盒的檢測范圍內,一般來說,建議樣品濃度為 0.5 - 1.5 μg/μL。如果樣品濃度過高或過低,可能會影響檢測結果的準確性。對于濃度不符合要求的樣品,可通過適當的稀釋或濃縮處理進行調整。同時,要保證樣品的純度,盡量減少蛋白質、鹽類等雜質的污染,以獲得更準確的檢測結果。
試劑準備:從試劑盒中取出所需的試劑,包括 RNA IQ 工作溶液等 。在使用前,需將試劑平衡至室溫,并輕輕混勻,避免產生氣泡。注意按照說明書的要求,正確配制工作溶液,確保試劑的有效性。同時,要注意試劑的保存條件,未使用完的試劑應及時放回冰箱中保存,避免反復凍融,影響試劑性能。
實驗操作流程:將準備好的 RNA 樣品與 RNA IQ 工作溶液按照 1:19 的比例混合均勻 ,例如,取 1 μL 的 RNA 樣品加入到 19 μL 的 RNA IQ 工作溶液中。混合后,將溶液轉移至 Qubit 4 熒光計專用的 500 μL 薄壁 PCR 管(貨號 Q32856)中,或者 Qubit Flex 熒光計專用的 8 x 200 μL 管條(貨號 Q33252)中。然后,將裝有樣品的管放入對應的熒光計中,按照儀器的操作指南進行檢測。熒光計會自動讀取熒光信號,并計算出 RNA IQ 編號以及樣品中大小 RNA 的百分比。
結果解讀:檢測完成后,熒光計會顯示出 RNA IQ 編號(RNA IQ#)以及樣品中大小 RNA 的計算百分比 。如前文所述,RNA IQ# 取值范圍為 1 至 10,數值越大,表明 RNA 的質量和完整性越好。科研人員可根據這個編號以及實驗的具體需求,判斷 RNA 樣品是否適合進行后續實驗。同時,結合大小 RNA 的百分比,能夠更全面地了解 RNA 樣品的組成情況,為實驗方案的調整提供參考。
存儲條件:為保證試劑盒的性能,應將其儲存于 -20°C 或更低溫度 。RNA 標準品則需儲存于 -80°C 或更低溫度。在儲存過程中,要注意避免試劑盒受到光照和潮濕環境的影響。開封后的試劑盒應盡快使用,并妥善保存剩余部分,防止試劑污染。在有效期內使用試劑盒,以確保實驗結果的可靠性。若發現試劑盒中的試劑出現渾濁、沉淀或顏色異常等情況,請勿使用。